MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Arthrobacter arilaitensis Re117 plasmid pRE117-2

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014548	GAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151710
2	NC_014548	A	6	6	111	116	100 %	0 %	0 %	0 %	308151710
3	NC_014548	CGGTG	2	10	145	154	0 %	20 %	60 %	20 %	308151710
4	NC_014548	TCC	3	9	174	182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308151710
5	NC_014548	TAA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308151710
6	NC_014548	GTT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308151710
7	NC_014548	ATT	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308151710
8	NC_014548	ATC	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151710
9	NC_014548	CGT	2	6	423	428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151710
10	NC_014548	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151710
11	NC_014548	GCC	2	6	452	457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151710
12	NC_014548	TGA	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308151710
13	NC_014548	GTG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308151710
14	NC_014548	TCT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308151711
15	NC_014548	GTG	2	6	731	736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308151711
16	NC_014548	CTT	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308151711
17	NC_014548	AGG	2	6	878	883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308151711
18	NC_014548	CCA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151711
19	NC_014548	GTG	2	6	992	997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308151711
20	NC_014548	GAA	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151711
21	NC_014548	GGA	2	6	1048	1053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308151711
22	NC_014548	AG	3	6	1086	1091	50 %	0 %	50 %	0 %	308151711
23	NC_014548	AGG	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308151711
24	NC_014548	TCC	2	6	1244	1249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308151711
25	NC_014548	AGA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151711
26	NC_014548	CGA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151711
27	NC_014548	GATCAG	2	12	1290	1301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308151711
28	NC_014548	GCC	2	6	1316	1321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151711
29	NC_014548	AAC	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308151711
30	NC_014548	CAC	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151711
31	NC_014548	CCA	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151711
32	NC_014548	G	6	6	1440	1445	0 %	0 %	100 %	0 %	308151711
33	NC_014548	CGG	2	6	1481	1486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151711
34	NC_014548	GAG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308151711
35	NC_014548	TGC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151711
36	NC_014548	GCT	2	6	1619	1624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151711
37	NC_014548	GGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151712
38	NC_014548	CAT	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151712
39	NC_014548	GAT	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308151712
40	NC_014548	GTC	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151712
41	NC_014548	AAG	2	6	2151	2156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151712
42	NC_014548	GCG	2	6	2507	2512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151713
43	NC_014548	GCT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151714
44	NC_014548	GC	3	6	2683	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	308151714
45	NC_014548	GTA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308151714
46	NC_014548	CGG	2	6	2735	2740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151714
47	NC_014548	TCC	2	6	2768	2773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308151714
48	NC_014548	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151714
49	NC_014548	TCA	2	6	2799	2804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151714
50	NC_014548	CGT	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151714
51	NC_014548	TAAC	2	8	2922	2929	50 %	25 %	0 %	25 %	308151714
52	NC_014548	GT	3	6	3035	3040	0 %	50 %	50 %	0 %	308151715
53	NC_014548	CAC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151715
54	NC_014548	GTGG	2	8	3085	3092	0 %	25 %	75 %	0 %	308151715
55	NC_014548	TG	3	6	3176	3181	0 %	50 %	50 %	0 %	308151715
56	NC_014548	CTT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308151715
57	NC_014548	CCG	2	6	3221	3226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151715
58	NC_014548	CGG	2	6	3316	3321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151715
59	NC_014548	TCAC	2	8	3352	3359	25 %	25 %	0 %	50 %	308151715
60	NC_014548	TTC	2	6	3465	3470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308151715
61	NC_014548	CAC	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151715
62	NC_014548	ACC	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151715
63	NC_014548	CTGCC	2	10	3642	3651	0 %	20 %	20 %	60 %	308151715
64	NC_014548	GT	3	6	3661	3666	0 %	50 %	50 %	0 %	308151715
65	NC_014548	TCC	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308151716
66	NC_014548	CAG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151716
67	NC_014548	CG	3	6	3881	3886	0 %	0 %	50 %	50 %	308151716
68	NC_014548	GGGT	2	8	3916	3923	0 %	25 %	75 %	0 %	308151716
69	NC_014548	CCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151716
70	NC_014548	GGCC	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	308151716
71	NC_014548	ACC	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151716
72	NC_014548	GCA	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151716
73	NC_014548	TTCCCG	2	12	4127	4138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	308151716
74	NC_014548	AGC	2	6	4142	4147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151716
75	NC_014548	TTC	2	6	4200	4205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308151716
76	NC_014548	GGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308151717
77	NC_014548	CGC	2	6	4395	4400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151717
78	NC_014548	GC	3	6	4399	4404	0 %	0 %	50 %	50 %	308151717
79	NC_014548	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151717
80	NC_014548	GGCC	2	8	4462	4469	0 %	0 %	50 %	50 %	308151717
81	NC_014548	CGCAG	2	10	4477	4486	20 %	0 %	40 %	40 %	308151717
82	NC_014548	GCG	2	6	4868	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308151718
83	NC_014548	GTTC	2	8	4971	4978	0 %	50 %	25 %	25 %	308151718
84	NC_014548	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308151718
85	NC_014548	CAT	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151718
86	NC_014548	GTGAA	2	10	5013	5022	40 %	20 %	40 %	0 %	308151718
87	NC_014548	GCT	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151718
88	NC_014548	GCAG	2	8	5236	5243	25 %	0 %	50 %	25 %	308151718
89	NC_014548	TCGC	2	8	5273	5280	0 %	25 %	25 %	50 %	308151718
90	NC_014548	AAT	2	6	5316	5321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308151718
91	NC_014548	GCT	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151719
92	NC_014548	CAA	2	6	5524	5529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308151719
93	NC_014548	TCG	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151719
94	NC_014548	CTG	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151719
95	NC_014548	TGT	3	9	5649	5657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308151719
96	NC_014548	AGC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151720
97	NC_014548	TGG	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308151720
98	NC_014548	CAG	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151720
99	NC_014548	ACC	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151720
100	NC_014548	C	6	6	6678	6683	0 %	0 %	0 %	100 %	308151720
101	NC_014548	TGG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308151720
102	NC_014548	AG	3	6	6813	6818	50 %	0 %	50 %	0 %	308151720
103	NC_014548	CAT	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308151720
104	NC_014548	C	6	6	6925	6930	0 %	0 %	0 %	100 %	308151720
105	NC_014548	ACC	2	6	6980	6985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151720
106	NC_014548	TCGG	2	8	7018	7025	0 %	25 %	50 %	25 %	308151720
107	NC_014548	GCA	2	6	7219	7224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151721
108	NC_014548	AAC	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308151721
109	NC_014548	GAT	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308151721
110	NC_014548	TCC	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308151721
111	NC_014548	TGC	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151721
112	NC_014548	CCA	2	6	7486	7491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308151721
113	NC_014548	TGC	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151721
114	NC_014548	GCT	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151721
115	NC_014548	CGC	2	6	7562	7567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308151721
116	NC_014548	AGA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308151721
117	NC_014548	CTTG	2	8	7660	7667	0 %	50 %	25 %	25 %	308151721
118	NC_014548	TGC	3	9	7874	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151722
119	NC_014548	GCT	2	6	8035	8040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151722
120	NC_014548	GATTG	2	10	8097	8106	20 %	40 %	40 %	0 %	308151722
121	NC_014548	CGAA	2	8	8137	8144	50 %	0 %	25 %	25 %	308151722
122	NC_014548	AAGC	2	8	8160	8167	50 %	0 %	25 %	25 %	308151722
123	NC_014548	GCA	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308151722
124	NC_014548	ACGA	2	8	8235	8242	50 %	0 %	25 %	25 %	308151722
125	NC_014548	GC	3	6	8251	8256	0 %	0 %	50 %	50 %	308151722
126	NC_014548	CTG	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308151722

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.